		SIM output with parameters:
		M = 1, I = -1, V = -1
		O = 6, E = 0.2

                 Upper Sequence : tob.38-44
                         Length : 6000
                 Lower Sequence : liv.42-48
                         Length : 6000

*********************************************************
      Number 1 Local Alignment
      Similarity Score : 3265.4
      Match Percentage : 76%
      Number of Matches : 4411
      Number of Mismatches : 950
      Total Length of Gaps : 378
      Begins at (2, 6) and Ends at (5711, 5395)

    0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    2 TATATATCATATATGTGGGTACATATTGTGTATCAAGAACAAAAAAATGC
      ||||||| ||||| ||-------------------| ||:  | | |:||
    6 TATATATAATATAAGT                   ATAATTTATATACGC

   50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   52 GGATATGGTCGAATGGTAAAATTTCTCTTTGCCAAGGAGAAGATGCGGGT
      ||:|||:||: ||||||||||||:|||:||||||||||||| ||||||||
   37 GGGTATAGTTTAATGGTAAAATTCCTCCTTGCCAAGGAGAATATGCGGGT

  100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
  102 TCGATTCCCGCTATCCGCCCAAGATCCAAGATAAAGTAATTTTATTACTA
      |||||||||||||:|||||-------------------------------
   87 TCGATTCCCGCTACCCGCC                               

  150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
  152 TTTATTTATTATTTAATTTCATAAATAGCATTAAATATATCCTTAAATTA
      -----------------------||| | | ||| || ---||||||  |
  106                        AATTGAAATAATTAG   CTTAAAAAA

  200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
  202 AGGATTTGGTATAGTTGGCCGTGATAGTGTAGTGATTCTATCCCTCCCCT
      ||:|----------------------------------------------
  130 AGAA                                              

  250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
  252 ACGTTTTCTTTTTCCTTCCACCCCCAAAAAGCGAAAGGCGGGAATTAATT
      ----------------------------------------------||| 
  134                                               AATA

  300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
  302 ACTAGTTAACAGAGTCAACCCTAAAATAGTTTGGCAAAACAAGATGTTGC
      | ||------------------|||||| |||  ----------| | ||
  138 AGTA                  AAAATATTTTTT          TTTGGC

  350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
  352 GGAGACAGGATTTGAACCCGTGACCTCAAGGTTATGAGCCTTGCGAGCTA
      ||||||||||||||||||::||||||||||||||||||||||||||||||
  160 GGAGACAGGATTTGAACCTATGACCTCAAGGTTATGAGCCTTGCGAGCTA

  400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
  402 CCAAACTGCTCTACCCCGCGCCGAAGATAAGAACTGAAAACTAATAGATA
      |||:||||||||||:|||||::: |: ||| :|  :||:  || |  |||
  210 CCAGACTGCTCTACTCCGCGTTATAATTAACGAAAAAAGTATACTCTATA

  450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
  452 AACAAGGATTAAATGCGCCCCTCCACCCTATCTGTACAAA       TAG
      || | ||| | ||----------------------||||:-------| |
  260 AAAATGGAATTAA                      ACAAGATATTTTTTG

  500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
  495 AATAGCCCATTTATACAGAATGGTAAAGGGGCTTCTATGATCATCGACCA
      ||||:|||-----------------------| :|| | || |  |:| :
  288 AATAACCC                       CGCCTCTTATAAGAGGCGG

  550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
  545 TAGAAATAGAAATGAAGCGTTAATCCTTACCAACTTGATCTTGTTGCTCC
      --------|||| :|| |   ||| :||||||||| |||:| |||:||||
  315         GAAAGAAACCCAAAATGTTTACCAACTAGATTTGGTTACTCC

  600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
  595 TGGCAACAAACATGCATGAACCATTTCACGAAGTATGTGTCCGGATAGTC
       |||||:||||||||||||:||||||||||||||| :||||::||||: |
  357 AGGCAATAAACATGCATGAGCCATTTCACGAAGTAAATGTCTAGATAAAC

  650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
  645 CAAAGTCTCGATAGTTAGCTCTCGGCCTTCCGGTCAAAAAACAACGTCGA
      ||||:|| |||||:|| |||:| ||:|||||:|||||||||||||| |||
  407 CAAAATCGCGATAATTTGCTTTAGGTCTTCCAGTCAAAAAACAACGACGA

  700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
  695 TGAAGGCGTGTAGGTGCACTATTCCGTGGTGGGGATTGTAACTTTCCATA
      |||||:|| || || |||||||| ||||||:::||||||||:|||:: |:
  457 TGAAGACGAGTCGGGGCACTATTACGTGGTAAAGATTGTAATTTTTTTTG

  750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
  745 AATTTCCCATTTGTCACTCAACGACGGAACCTTGCTTATTTCTTTCTTTG
      || ||||||||| |||:::||:||:|:::::|:  | ||||:|||:|||:
  507 AAATTCCCATTTTTCATCTAATGATGAGGTTTCCGTAATTTTTTTTTTTA

  800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
  795 AGGATCGACGAATCGAATGATATTTCTGTTCCAATTTTTGCCTCTTCTTC
      |:|| : ||| |  :  | :|||||:| |||:|| |||||:||:||:||:
  557 AAGAATTACGTAAAATTTTGTATTTTTTTTCTAAATTTTGTCTTTTTTTT

  850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
  845 TCCCTCTGAATCAAACTTTTCCTTGCCATAATGGTTGAATTCCTA     
      ||:||:||||| |:|||:||::|||||||||| :|| ||||  ||-----
  607 TCTCTTTGAATAAGACTCTTTTTTGCCATAATTATTTAATTAGTAAGATA

  900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
  890            TTAGTATCCATGATACAAGTCGAATCCTAGATGTAGAAA
      -----------| |:| |::|| | | ||  :      ||:|  |:||||
  657 TTCTTTTTCAATAAATTTTTATTAAAAAATATTTTGAGTAAAATTGGAAA

  950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
  929 TAGAAGAAGGTGGACCCCCTCTCCGTCGAAAGAAATGAGATTATCGCAGA
      |  ||---------------------------------------------
  707 TTTAA                                             

 1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
  979 TACACACATTAAAAATAT    TAACCAAATTTGCCCGACGTAGAGGCAA
      ---------|| ||||||----|||||||||||:|| ||:|||||:||||
  712          TACAAATATAATTTAACCAAATTTACCAGATGTAGAAGCAA

 1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 1025 TCAAGAAAGCCGCATAAGTGAATATATAACCTACAGAAAAGTGAGCTAAT
      |:||:||||| ||||||||:||||||||||||||||||||:|||||||||
  753 TTAAAAAAGCAGCATAAGTAAATATATAACCTACAGAAAAATGAGCTAAT

 1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 1075 CCAACCAATCTTGCTTGTACAATGGAAAGGGCCACTGGTTTATCTCTCCA
      |||||:||||||||||| |||||:|||||:||:||||||||||||:||||
  803 CCAACTAATCTTGCTTGAACAATAGAAAGAGCTACTGGTTTATCTTTCCA

 1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 1125 GCGAATCAAATTGGCCAAAGGTGTGCGTTCATGAGCCCATGCTAAAGTTT
      |||||::||||| ||:||||| ||:|||||:|||||||| ||||||||||
  853 GCGAACTAAATTCGCTAAAGGAGTACGTTCGTGAGCCCAAGCTAAAGTTT

 1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 1175 CAATCAATTCCTGCCAATATCCACGCCAAGAAATTAAGAACATAAATCCA
      |||| |:|||:||||||||||||||||| || ||:|::||||||||||||
  903 CAATAAGTTCTTGCCAATATCCACGCCACGATATCAGAAACATAAATCCA

 1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 1225 GTAGCCCAAACAAGATGTCCAAATAAGAACATCCATGCCCAAACCGATAA
      ||||||||||| |:||| ||||||||:||||||||||||||||| ||:|:
  953 GTAGCCCAAACTAAATGACCAAATAAAAACATCCATGCCCAAACAGACAG

 1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 1275 ACTATTCATACCAAAAGGATTATATCCGTTGATAAGTTGTGAAGAGTTTA
      |||||||||||||||||||||||||||:||:|| |:|||||||||:||||
 1003 ACTATTCATACCAAAAGGATTATATCCATTAATCAATTGTGAAGAATTTA

 1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 1325 ACCATAAATAATCCCTTAACCAGCCCATCAAATAAGTGGAAGATTCATTA
      |||||||||||||:||||||||||||||:||||| ||:||||||||||||
 1053 ACCATAAATAATCTCTTAACCAGCCCATTAAATATGTAGAAGATTCATTA

 1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 1375 AACTGTGAAACGTTACCCTGCCATAATGTGATGTGCTTCCAATGCCAATA
      ||:||||  :|:|| ||:|||||||||||:||:||:||||||||||||||
 1103 AATTGTGCTGCATTTCCTTGCCATAATGTAATATGTTTCCAATGCCAATA

 1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 1425 AAAAGTAACCCATCCAATAGTATTTAACATCCAAAAAACTGCCAAATAAA
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||
 1153 AAAAGTAACCCATCCAATAGTATTTAACATCCAAAAAACTGCTAAATAAA

 1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 1475 ACGCGTCCCATGCCGAAATATCACAAGTACCGCCTCGTCCTGGGCCATCG
      | ||:||||| || |||||||||||||||||:|||||||| ||:|||||:
 1203 AAGCATCCCAAGCAGAAATATCACAAGTACCACCTCGTCCAGGACCATCA

 1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 1525 CACGGAAAACTATAACCGAAATCCTTTTTATCTGGCATTAACTTGGAACC
      || ||||||||||||||:|| ||:|||||||||||||||||:||:|| ||
 1253 CAAGGAAAACTATAACCAAATTCTTTTTTATCTGGCATTAATTTAGATCC

 1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 1575 ACGTGCATCTAAAGCACCTTTTACTAAGATCAATGTAGTTGTATGTAAAC
       ||||||||||||||||||||:|||||:||:|||||||| ||||||||||
 1303 TCGTGCATCTAAAGCACCTTTCACTAAAATTAATGTAGTAGTATGTAAAC

 1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 1625 CAAGAGCAATAGCATGATGAACCAAAAAGTCTCCAGGACCTATTGTTAAA
      | |:|||||||||:||||| ||:||||||||||||||||| ||||||||:
 1353 CTAAAGCAATAGCGTGATGTACTAAAAAGTCTCCAGGACCAATTGTTAAG

 1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 1675 AATAATGAATTACTATTTTCATTAACAGCATTTAACCAACCCGGCAACCA
      || |:|||||||||||| |:||| |:|||||:||||||||| ||:|||||
 1403 AAAAGTGAATTACTATTATTATTTATAGCATCTAACCAACCAGGTAACCA

 1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 1725 GATGCTTCGACCCGCATTGAATGCTGGACCACTCGTTGAAGATAAAAGTA
       ||||||:|||| |||||:|||||||||::|:|:||||| ||||||||||
 1453 TATGCTTTGACCAGCATTAAATGCTGGATTATTTGTTGATGATAAAAGTA

 1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 1775 CATCGAACCCATATGAAGTTTTACCATGAGCGGATTGTATCCATTGAGCA
      ||||:|| ||||||:|||:||||||||||||:||||||||||||||||||
 1503 CATCAAAACCATATAAAGCTTTACCATGAGCAGATTGTATCCATTGAGCA

 1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 1825 AATATAGGTTCAATCAAGATTTGCTTCTCCGGAGTGCCAAAGGCAAGCAT
      || |||||||||||:||:|||||:||:|| |||||:|||||:||||||||
 1553 AAAATAGGTTCAATTAAAATTTGTTTTTCAGGAGTACCAAAAGCAAGCAT

 1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 1875 GACATCATTATGAACATAAAGTCCCAGGGTATGGAATCCCAGAAAGAGGC
      :||||||||||||||:||||| ||:|::|||||:|||||:||||| |::|
 1603 AACATCATTATGAACGTAAAGACCTAAAGTATGAAATCCTAGAAATAAAC

 1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 1925 TGGCCCAACTTAAATGAGATATGATAGCTTCTTTATGCTCTAACATTCTT
      |:||||||||||||||:||||| ||||||||||||||:||||||||||| 
 1653 TAGCCCAACTTAAATGGGATATTATAGCTTCTTTATGTTCTAACATTCTA

 2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 1975 GCCAATACATTATCTTCATTTTGCTCCGGATTGTAATCTCTAATGAAAAA
      ||:|||||||||||||:||||||:||||||||:|||||||||||:||:||
 1703 GCTAATACATTATCTTTATTTTGTTCCGGATTATAATCTCTAATAAAGAA

 2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 2025 TATAGCTCCATGAGCAAAAGCTCCTGTCATGATGAATCCTGCGATATATT
       |||||||||||||||||||| ||||||||:||:|| || ||:|||||||
 1753 AATAGCTCCATGAGCAAAAGCACCTGTCATAATAAAACCAGCAATATATT

 2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 2075 GGTGGTGGGTATATAATGCAGCTTGAGTAGTAAAGTCTTGTGCTATGAAT
      |:||:||:||||||||||||||||| || |||||:|||||||| | :||:
 1803 GATGATGAGTATATAATGCAGCTTGCGTTGTAAAATCTTGTGCAAGAAAC

 2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 2125 GCATAAGCAGGTAAAGAGTACATGTGTTGAGCTACCAAAGAAGTAATAAC
      |||||:| |||||||||:|||||:|||||||||||:||:||:||||||||
 1853 GCATAGGGAGGTAAAGAATACATATGTTGAGCTACTAAGGAGGTAATAAC

 2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 2175 CCCTAAAGAAGCTAGAGCAAGGCCTAATTGAAAATGAAGCGAATTATTGA
      :||||| || ||||:||||||:||||||||||||||||| |||||:||:|
 1903 TCCTAACGATGCTAAAGCAAGACCTAATTGAAAATGAAGAGAATTGTTAA

 2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 2225 TTGTGTCATAAAGACCCTTATGTCCACGCCCCAATCGTCCCCCGGGGGGA
      | ||:|||||||||||:|||||||| || ||:|| |||||:|| ||:|||
 1953 TAGTATCATAAAGACCTTTATGTCCTCGACCTAAACGTCCTCCTGGAGGA

 2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 2275 ATATGTGCATCTAAAAGGTCTTTCATACTGTGCCCAATCCCGAAATTGGT
      :|||| |: || |:||  ||||| |||||:|| |||||:||:|||||:||
 2003 GTATGGGTTTCAAGAATTTCTTTGATACTATGACCAATTCCAAAATTAGT

 2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 2325 TCTATACATATGACCAGCAACGAGAAAAATAAATGCAATAGCTAAATGGT
      |||||||||||||||||| |::| |||||:|| |||||||||||||||:|
 2053 TCTATACATATGACCAGCTATAATAAAAACAACTGCAATAGCTAAATGAT

 2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 2375 GATGGGCAATATCAGTCAGCCATAAACTTTGCGTTTGTGGATGGAATCCC
      |:||:||||||||||| ||||||||||||||:|||||||||||:||||| 
 2103 GGTGAGCAATATCAGTAAGCCATAAACTTTGTGTTTGTGGATGAAATCCA

 2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 2425 CCGAGAAGAGTTAGAATGGCAGTTCCCGCCCCTTGGGCGGTACCAAATAA
      ||:| ||:|||||::||:|| ||||| ||||||||:|  || ||||| : 
 2153 CCAATAAAAGTTAAGATAGCTGTTCCAGCCCCTTGAGATGTTCCAAAAGC

 2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 2475 ATGACTACTTGAATCGGGGTTTTGAGCATAAAGATTCCATTGACCTGTAA
      ||||:|||||||||||: :||||||||:|||| ||||||||| ||||:||
 2203 ATGATTACTTGAATCGACATTTTGAGCGTAAATATTCCATTGTCCTGCAA

 2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 2525 AAAGTGGGCCTAACCCTTGGGGATGCGGTAATACATCTAAGAAATTATTC
      |||:|||:||||::||||  |||||:|||||| :  :|||:|||||||:|
 2253 AAAATGGACCTAGTCCTTCCGGATGTGGTAATTTTGTTAAAAAATTATCC

 2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 2575 CACCGAACGTACTCCCCTCTGGATGCAGGAATAGCAACATGAACTAAATG
      ||:|  ||||::|| ||||| ||| | ||||| || ||||||||||||||
 2303 CATCTTACGTGTTCGCCTCTTGATTCTGGAATTGCCACATGAACTAAATG

 2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 2625 CCCTGTCCAAGCCAAGGAACTTACGCCAAAGAGTCCTGACAAATGATGAT
       |||||||||||:|| ||:|||||:|||||:||||||||:||||||||||
 2353 ACCTGTCCAAGCTAATGAGCTTACACCAAAAAGTCCTGATAAATGATGAT

 2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 2675 TCAGACGAGATTCGGCATTTTTGAACCAGGAAACGCTCGGTTTCCATTTC
      |:|:|||||||||:||||||||:|||||||| || :| ||||||||||| 
 2403 TTAAACGAGATTCAGCATTTTTAAACCAGGATACTTTAGGTTTCCATTTA

 2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 2725 GGTTGTAGGTGTAACCAACCTGCTATTAAGGATATGGCAGAAAGAAATAA
      |||||||::||||||||||||||||||||||| ||:|  |||||||  | 
 2453 GGTTGTAAATGTAACCAACCTGCTATTAAGGAAATAGACGAAAGAATAAC

 2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 2775 TAGAAAAAGAGCACCAGTATAAAGATCTTCATTAGTGCGTAAACCGATTG
      ||:||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||:||||
 2503 TAAAAAAAGAGCTCCATTATAAAGATCTTGATTAGTTCGTAAACCAATTG

 2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 2825 TATACCACCACTGATAAACACCAGAATAAGCGATATTCACTGGGCCAAGA
      ||||||||||:||:|| ||||||||||| || ||||| ||||| |||::|
 2553 TATACCACCATTGGTATACACCAGAATATGCTATATTAACTGGTCCAGAA

 2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 2875 GCACCCCCTCGAGTAAAAGCTTCCACGGCCGGTTGACCAAAATGAGGATC
      || ||:||||||||||||||||| ||:||:|||||||||||||| |||||
 2603 GCTCCTCCTCGAGTAAAAGCTTCAACAGCTGGTTGACCAAAATGCGGATC

 2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 2925 CCAAATTGCATGAGCAATAGGTCTTACATGTAAAGGGTCCTGTACCCACG
      |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||:||| ||||:|
 2653 CCAAATTGCATGAGCAATTGGTCTGACATGTAAAGGGTCTTGTCCCCATG

 3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 2975 ACTCAAAATTTCCTTGCCAAGCTACATGAAACAGATTTCCGGAAGTCCAC
       :|||||||| ||||||||||| ||:|||||:|:||| ||:||||||||:
 2703 CTTCAAAATTACCTTGCCAAGCAACGTGAAATAAATTACCAGAAGTCCAT

 3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 3025 AGAAAAATTATTGCTAATTGACCAAAGTGAGAAGCAAAAATATTCTGATA
      |:|||||| |||||||||||||||||:|| || |||||||| ||:|||||
 2753 AAAAAAATGATTGCTAATTGACCAAAATGTGACGCAAAAATCTTTTGATA

 3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 3075 AAGACGTTCCTCAGTAATATCATCATGACTCTCGAAGTCATGTGCGGTAG
      |||||||||:||||| ||||||||||||||:||:|||||||||||||| |
 2803 AAGACGTTCTTCAGTCATATCATCATGACTTTCAAAGTCATGTGCGGTCG

 3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 3125 CAATACCAAACCAAATACGACGAGTAGTGGGGTCCTGAGCTAAGCCTTGG
      |||||||||||||||||||||| ||||| |||||:|||| ||:|||:|||
 2853 CAATACCAAACCAAATACGACGCGTAGTTGGGTCTTGAGATAGGCCCTGG

 3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 3175 CTAAACCTTGGAAATCGTAATGCCATAATGCTTTTCAAATCCTCCT AGC
      |||||::| ||||||| |:|||||||||||||||||||||||||||-|||
 2903 CTAAATTTGGGAAATCTTGATGCCATAATGCTTTTCAAATCCTCCTTAGC

 3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 3224 CATTATCCTACTGCAATAATTCTTGCTAAGAAGAATGCCCATGTTGTGGC
      ||||||||||||||||||||||||||||::||||||||||||||||||||
 2953 CATTATCCTACTGCAATAATTCTTGCTAGAAAGAATGCCCATGTTGTGGC

 3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 3274 AATTCCACCCAGAAGGTAATGGGTTACTCCTACAGCACGTCCTTGTATAA
      |||||||||:|||||||||||:|:||||||||||||||| ||||||:|||
 3003 AATTCCACCTAGAAGGTAATGAGCTACTCCTACAGCACGGCCTTGTGTAA

 3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 3324 TGCTCAAGGCTCTCGGCTGAGTAGCAGGAGCAACTTTTAATTTATTATGA
      |:||:||||| |  |||||::||||||||||||||||||||||:||:|||
 3053 TACTTAAGGCGCGAGGCTGGATAGCAGGAGCAACTTTTAATTTGTTGTGA

 3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 3374 GCCCAAACGATGGATTCAATAAGTTCTTGCCAATAACCACGTCCACTGAA
      ||||||||:||||||||||||||:||||||||||| ||||| |||||:||
 3103 GCCCAAACAATGGATTCAATAAGCTCTTGCCAATATCCACGACCACTAAA

 3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 3424 TAGAAACATTAAACTAAAAGCCCAGACAAAATGAGCACCTAGGAAAAAAA
      ||::||||||||||||||||||||:|||||:||||||||||::|| ||||
 3153 TAAGAACATTAAACTAAAAGCCCAAACAAAGTGAGCACCTAAAAATAAAA

 3500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 3474 GGCCATATGCAGATAATGAAGAACCATAAGACTGAATTACCTGGGATGCC
      |:||||| |||||||| ||||||||||||||:||||||||:||:|| ||:
 3203 GACCATAAGCAGATAAGGAAGAACCATAAGATTGAATTACTTGAGAAGCT

 3550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 3524 TGTGCCCATAAGAAATCGCGGAGCCACCCATTAATAGTAATAGAACTTTG
      |||||||||||:||:||:||:||||| |||||||||||||||| :|||||
 3253 TGTGCCCATAAAAAGTCACGAAGCCAACCATTAATAGTAATAGCGCTTTG

 3600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 3574 CGCAAAGTTTCCTCCCGTGATATGAGTTACTACCCCTTGATCACTTACAC
      :|||||:||||| || ||:||||||||||| || ||||| ||:||||:| 
 3303 TGCAAAATTTCCACCGGTAATATGAGTTACAACACCTTGCTCGCTTATAG

 3650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 3624 TGCCCCAAACATCTGACTGCATTTTCCAACTGAAATGGAATATTACTACC
      |:||||||||||| ||:||||||||||||||:||:||:|| || ||||| 
 3353 TACCCCAAACATCAGATTGCATTTTCCAACTAAAGTGAAAAATAACTACA

 3700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 3674 GAAATTGCATTGTACATCCAGAATAGTCCTAAGAAGACATGATCCCAGGC
      ||||| | |||:||||||||:||||: ||||||||:||||||||||| ||
 3403 GAAATAGAATTATACATCCAAAATAAACCTAAGAAAACATGATCCCATGC

 3750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 3724 CGATACTTGACATGTACCCCCTCTTCCAGGTCCATCACAAGGAAAACGAA
       ||||||||||| || ||:|||||||||||||||||:|||||||||||||
 3453 AGATACTTGACAAGTTCCTCCTCTTCCAGGTCCATCGCAAGGAAAACGAA

 3800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 3774 AACCAAGGTTTGCTTTATCCGGTGTCAAACGGGAACTGCGAGCAAATAGA
      |||||||:|| |||||:||:|||:|||||||:||||| ||||||||||:|
 3503 AACCAAGATTAGCTTTGTCTGGTATCAAACGAGAACTTCGAGCAAATAAA

 3850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 3824 ACACCTTTCAAGAGTATCAGTGCCGTCACATGAATCGTAAATGCATGAAT
      ||||||||:|| |: ||:|: :| ||:||||||||:||||||||||||||
 3553 ACACCTTTTAATAAAATTAAAACAGTTACATGAATTGTAAATGCATGAAT

 3900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 3874 GTGATGTACCAAGAAATCCGCGGTTCCTAATGGAATAGGCAACAAAGCCA
      :||||||||:||:|||||:|| ||||||||:||||| ||:||:||||| |
 3603 ATGATGTACTAAAAAATCTGCTGTTCCTAACGGAATTGGTAATAAAGCAA

 3950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 3924 CCTTGCCACCCACTGCCACTAAATCACCACCCCCCCAAGTTAAACTGGTA
      |:||:|:||| |||||:|:|| :|| ||||| ||||| ||||||||:|||
 3653 CTTTACTACCAACTGCTATTACGTCTCCACCACCCCATGTTAAACTAGTA

 4000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 3974 CTTGCTGTTGCACCAGGAGCCGTTGCACCAGGTGCTAAAGCATGGGTGTT
      ||||||:  |||::|||||| || : ::: |||||||||||||| |||||
 3703 CTTGCTAAAGCATTAGGAGCAGTAAAGTTTGGTGCTAAAGCATGTGTGTT

 4050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 4024 TTGTATCCATTGAGCAAAAACGGGTTGTAATTGTATAGCGGTATCTGAAA
      |||||||||||||||||||||:||||||||||| |||||:||||||||||
 3753 TTGTATCCATTGAGCAAAAACAGGTTGTAATTGAATAGCAGTATCTGAAA

 4100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 4074 ACATATCTTGAGGACGCCCTAAAGCGCTCATGGTATCATTATGAATATAC
      ||||||||||||||||:||||||||:||||| |||||||||||||||||:
 3803 ACATATCTTGAGGACGTCCTAAAGCACTCATCGTATCATTATGAATATAT

 4150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 4124 AAACCAAAACTGTGAAAGCCTAGAAATATACATGCCCAGTTGAGATGGGA
      || ||||||||:||||| ||||:||| ||:|||:||||:||:||||| ||
 3853 AATCCAAAACTATGAAATCCTAAAAAGATGCATACCCAATTAAGATGTGA

 4200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 4174 TATGATTGCATCACGATGTCTAAGGACACGATCTAATAGATCGTTGTACC
      ||| |||||||||||||||| |||:|| ||||||||:|:||:||||||::
 3903 TATTATTGCATCACGATGTCGAAGAACTCGATCTAACAAATTGTTGTATT

 4250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 4224 GAGTAGTTGGATCATAATCTCTTACCATAAAAATGGCTGCATGCGCGGCA
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||:|| |||||:||:|||
 3953 GAGTAGTTGGATCATAATCTCTTACCATAAAAATAGCAGCATGTGCAGCA

 4300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 4274 GCACCAACTATGAGAAATCCACCAATCCACATGTGATGTGTGAACAATGA
      ||||||||||| |:||||||||||||||||||:||||||||:|| |: ||
 4003 GCACCAACTATTAAAAATCCACCAATCCACATATGATGTGTAAAAAGAGA

 4350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 4324 CAGTTGTGTACCATAGTCAGTAGCTAGATACGGATAAGGGGGCATGGAAT
       ||||| |||||:||:||||||||||:|||:||||||||:|||||:| :|
 4053 AAGTTGAGTACCGTAATCAGTAGCTAAATATGGATAAGGAGGCATAGCGT

 4400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 4374 ACATATGGTGAGCTACAACAATGGTTAAAGAGCCTAACATAGCTAAGTTA
      |||||||:||||||||||:|||:||||||||:||:|||||||||||:|||
 4103 ACATATGATGAGCTACAATAATAGTTAAAGAACCCAACATAGCTAAATTA

 4450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 4424 AGAGATAATTGAGCATGCCATGACGTTGTTAGGATCTCATATAGGCCTTT
      || | |||||||||||||||||| |||||||::||:||||| ||:|||||
 4153 AGTGCTAATTGAGCATGCCATGAAGTTGTTAAAATTTCATAAAGACCTTT

 4500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 4474 ATGGCCCTGACCTGTAAATGGACCTTTATGAGCTTCTAAAATATCTTTTA
      |||:||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
 4203 ATGACCCTCTCCAGTAAATGGACCTTTATGAGCTTCTAAAATTTCTTTAA

 4550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 4524 GTCCATGACCAATACCCCAGTTGGTCCTATACATGTGACCCGCTATCAGG
      : |:||||||:|||||||||||:|| | ||||||:|||||:||||::|::
 4253 AACTATGACCGATACCCCAGTTAGTACGATACATATGACCTGCTACTAAA

 4600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 4574 AAAAGAATTGCAATAGCTAAATGGTGATGGGCAATATCAGTCAGCCACAG
      |||||||:|||||||||||||||:|||||:|| :|||||||:|:|||:|:
 4303 AAAAGAACTGCAATAGCTAAATGATGATGAGCTGTATCAGTTAACCATAA

 4650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 4624 ACCCCCAGTTACTGGATCTAATCCTCCACGAAAAGTAAGAAAGTCCGCAT
      ||| |||||||||||||: |:||||||||||||||| |:|||||| | ||
 4353 ACCGCCAGTTACTGGATTAAGTCCTCCACGAAAAGTTAAAAAGTCAGAAT

 4700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 4674 ATTTTGACCAATTCAAGGTGAAAAATGGGGTTGCTCCCTCGGCAAAACTG
      |||:|||||||||:||:||:||||| ||:|||: :||:|: ||||||||:
 4403 ATTCTGACCAATTTAAAGTAAAAAAAGGAGTTAACCCTTTTGCAAAACTA

 4750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 4724 GGATAAAGTTGAGCCAAAAGATCTCGATTCAAGATAAATTCATGAGGAAG
      ||:||||||| |||:|||||||| |||||:||:|||||||||||||||||
 4453 GGGTAAAGTTCAGCTAAAAGATCACGATTTAAAATAAATTCATGAGGAAG

 4800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 4774 TGGTATCTCTTTAGGATCTACTCCAGCGTTTAGAAATTGGTTAATCGGTA
       |||||:||||| ||||| ||||||||:|:||:||::||:||||| ||||
 4503 AGGTATTTCTTTTGGATCAACTCCAGCATCTAAAAGCTGATTAATAGGTA

 4850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 4824 AAGATACATGTACTTGATGCCCCGCCCAAGAGAGAGACCCAAGTCCTAGT
      |||| ||||||||||||||:|| ||||||||:||||| || |: ||||: 
 4553 AAGAAACATGTACTTGATGTCCAGCCCAAGAAAGAGAACCTAAGCCTAAA

 4900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 4874 AGCCCTGCCAAATGGTGATTCAGCATAGATTCTACATCTTGAAACCAAGC
      || |||||:|||||:|||||:||||||||||| |||||||||||||||||
 4603 AGACCTGCTAAATGATGATTTAGCATAGATTCAACATCTTGAAACCAAGC

 4950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 4924 CAATTTTGGCGCCGCTTTATGATAATGAAACCAACCAGCAAAAAGCATTA
      :|||||||| || |||||:|||||||||||||| || |||||||||||||
 4653 TAATTTTGGAGCAGCTTTGTGATAATGAAACCATCCTGCAAAAAGCATTA

 5000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 4974 ACGCTGCAAAGACCAATGCCCCAATTGCTGTACAATAGAGTTGTAATTCA
      |:||||||||:||:||| | |||||||| ||| ||||:||||||||||||
 4703 ATGCTGCAAAAACTAATCCACCAATTGCAGTAGAATAAAGTTGTAATTCA

 5050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 5024 CTAGTTATTCCAGATGCTCGCCAAATCTGAAAAAAACCAGAGGTTATTTG
      ||||||||||||||||||||||||| :||||||||:||:|||||||||||
 4753 CTAGTTATTCCAGATGCTCGCCAAAGTTGAAAAAAGCCGGAGGTTATTTG

 5100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 5074 TATTCCTCGGAAACCCCCGCCTACGTCACCATTTAATATTTCTTGGCCCA
      |||||||:|:||||||||||| ||:|| |||||||| ||||||||:|| |
 4803 TATTCCTTGAAAACCCCCGCCAACATCCCCATTTAAAATTTCTTGACCAA

 5150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 5124 CTATTGGCCAAACCACCTGGGCACTAGGCCCAATGTGAGTTGGATCACTT
      |||| |||||||| ||:||:|||||:|||::|||:||||| |||||||||
 4853 CTATAGGCCAAACAACTTGAGCACTGGGCTTAATATGAGTAGGATCACTT

 5200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 5174 AGCCACGCTTCATAATTAGAAAAACGAGCACCGTGGAAATACATGCCGCT
      |:|||:||||||||||||||||||||||||||:||:||:|||||:||:||
 4903 AACCATGCTTCATAATTAGAAAAACGAGCACCATGAAAGTACATACCACT

 5250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 5224 CAGCCAAAGAAAGATGATGGAGAGTTGACCGAAATGTGCACTAAATACTT
      :|:||||| |||:|||||||  |:||| ||:||||| |||||||| ||:|
 4953 TAACCAAATAAAAATGATGGCTAATTGCCCAAAATGAGCACTAAAAACCT

 5300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 5274 TTCGAGAGATCTCCTCCAAATCACTGGTATGGCTATCGAAATCGTGAGCA
      | |||||:||:||:||:||||||:||||||||||:||:|||||:||||||
 5003 TACGAGAAATTTCTTCTAAATCATTGGTATGGCTGTCAAAATCATGAGCA

 5350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 5324 TCAGCATGTAGGTTCCAGATCCAAGTGGTAGTATCAGGCCCTTTAGCTAT
      ||||||||||::|||||:|||||||||||||||::||| ||:||||||| 
 5053 TCAGCATGTAAATTCCAAATCCAAGTGGTAGTACTAGGACCCTTAGCTAG

 5400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 5374 TGTTCTTGAGAAATGACCCGGTCTGGCCCATTCCTCGAACGAAGTTTTTA
       ||:|||||:||||| || |||:|:|||||||::||:|| ||:|||||||
 5103 AGTCCTTGAAAAATGCCCAGGTTTAGCCCATTTTTCAAAAGAGGTTTTTA

 5450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 5424 CGGGATCCCTATCTACCAAAATTTTAACTTCTGGTTCCGGCGAACGAATA
      |:||||||:| ||:|||| |||:||:||||||||||||||:|||||||||
 5153 CAGGATCCTTTTCCACCACAATCTTGACTTCTGGTTCCGGTGAACGAATA

 5500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 5474 ATCATTGAG TCCTCCTCTTTCCGGACAACACATACAAAGAGACCCGCCA
      :||||:|||-|:|||||||:|:|:|||:| :|||| :||-|:|||::|||
 5203 GTCATCGAGGTTCTCCTCTCTTCAGACGAGGCATAGGAA AAACCTACCA

 5550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 5523 ACAGTCAAATAATTAGTGAACCTTAGAGATAGAGAGATATTTCTATAATT
      |||-----|||||||||:|||:|: |||| |   | ||||  || |----
 5252 ACA     ATAATTAGTAAACTTCTGAGAGATCCATATATAACTTT    

 5600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 5573 AGTTCGTTTCTCTTCTATTTTTCTATCTCCCATCTATCTATTTTCTTTAG
      ---------------||  |:||| ||||-------------------||
 5293                TAGATCTCTTTCTC                   AG

 5650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 5623 TTATTTACTAGAGCAATTATGATCTGGAAGTCGATCCGGGGCAAGTGTTC
      ||    |||:||:|||:||| || ::|||:|::--|| :||||:|| |||
 5309 TTTAAAACTGGAACAACTATTATACAGAAATTA  CCTAGGCAGGTCTTC

 5700     .    :    .    :    .    :    .
 5673 GGATCTATTATGACATAGCCTTGAGGCGCTCAACGGACC
      ::||:||||||||||:|:::||:|||:|||:||:|||||
 5357 AAATTTATTATGACACAATTTTAAGGTGCTTAATGGACC

*********************************************************
      Number 2 Local Alignment
      Similarity Score : 278.4
      Match Percentage : 55%
      Number of Matches : 1171
      Number of Mismatches : 711
      Total Length of Gaps : 218
      Begins at (1156, 3100) and Ends at (3152, 5084)

    0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 1156 TGAGCCCATGCTAAAGTTTCAATCAATTCCTGCCAATATCCACGCCAAGA
      |||||||| :| | :| |||||| |::||:|||||||||||||| | |  
 3100 TGAGCCCAAACAATGGATTCAATAAGCTCTTGCCAATATCCACGACCACT

   50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 1206 AATTAAGAACATAAATCCAGTAGCCCAAACAAGATGTCCAAATAAGAACA
      || ||||||||| || |:|: |||||||||||::||  ||  |||:||:|
 3150 AAATAAGAACATTAAACTAAAAGCCCAAACAAAGTGAGCACCTAAAAATA

  100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 1256 TCCATGCCCAAACCGATAAACTATTCATACCAAAAGGATTATATCCGTTG
         :  | :||:| |||||: ------------|||:|::|||    | :
 3200 AAAGACCATAAGCAGATAAGG            AAGAACCATAAGATTGA

  150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 1306 ATAAGTTGTGAAGAGTTTAACCATAAATAATCCCTTAACCAGCCCATCAA
      || | ||| ||||  | |: ||||||| |:|| |  |:|||:||  | | 
 3238 ATTACTTGAGAAGCTTGTGCCCATAAAAAGTCACGAAGCCAACCATTAAT

  200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 1356 ATAA          GTGGAAGATT     CATTAAACTGTGAAACGTTAC
      |  |----------||| ||:|||-----|: |||  || |  ||: :||
 3288 AGTAATAGCGCTTTGTGCAAAATTTCCACCGGTAATATGAGTTACAACAC

  250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 1391 CCTGC                      CATAATGTGATGTGCTTCCAATG
      |:|||----------------------|| | ||:: |----||||||: 
 3338 CTTGCTCGCTTATAGTACCCCAAACATCAGATTGCATT    TTCCAACT

  300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 1419 CCAATAAAAAGTAACCCATCCAATAGTATTTAACATCCAAAAAACTGCCA
        |:|:||||:||||:     ||||| |||  |||||||||| |   |:|
 3384 AAAGTGAAAAATAACTACAGAAATAGAATTATACATCCAAAATAAACCTA

  350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 1469 AATAAAACGCGTCCCATGCCGAAATATCACAAGTACCGCCTCGTCCTGGG
      |: |||    :|||||||| || |: | |||||| || |||| ||| || 
 3434 AGAAAACATGATCCCATGCAGATACTTGACAAGTTCCTCCTCTTCCAGGT

  400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 1519 CCATCGCACGGAAAACTATAACCGAAATCCTTTTTATCTGGCATTAACTT
      |||||||| ||||||| | ||||:|:||:  :|||:|||||:||:|| : 
 3484 CCATCGCAAGGAAAACGAAAACCAAGATTAGCTTTGTCTGGTATCAAACG

  450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 1569 GGAACCACGTGCATCTAAAGCACCTTTTACTAAGATCAATGTAGTTGTAT
      :||||: || |||  ||||:||||||||| |||:||:|| ::||||::||
 3534 AGAACTTCGAGCAAATAAAACACCTTTTAATAAAATTAAAACAGTTACAT

  500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 1619 GTAAACCAAGAGCAATAGCATGATGAACCAAAAAGTCTCCAGGACCTATT
      | |   :||: |||  |::|||||| ||:|||||:||| | |  |||| :
 3584 GAATTGTAAATGCATGAATATGATGTACTAAAAAATCTGCTGTTCCTAAC

  550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 1669 GTTAAAAATAATGAATTACTATTTTCATTAACAGCATTTAACCAACCCGG
      |  |  ::||||:|| :| : || ::|::||| ||  |||--|: |:| :
 3634 GGAATTGGTAATAAAGCAACTTTACTACCAACTGCTATTA  CGTCTCCA

  600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 1719 CAACCAGATGCTTCGACCCGCATTGAATGCTGGACCACTCGTTGAAGATA
      | |||  |||-|| :||: |:|:|---||||::| ||:| |  | ||  |
 3682 CCACCCCATG TTAAACTAGTACT   TGCTAAAGCATTAGGAGCAGTAA

  650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 1769 AAAGTACATCGAACCCATATGAAGTTTTACCATGAGCGGATTGTATCCAT
      |:---------------| ||: |:|  | |||| |:|  ||||||||||
 3728 AG               TTTGGTGCTAAAGCATGTGTGTTTTGTATCCAT

  700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 1819 TGAGCAAATATAGGTTCAATCAAGATTTGCTTCTCCG             
      |||||||| |:|||||  | : ::||     | ||:|-------------
 3763 TGAGCAAAAACAGGTTGTAATTGAATAGCAGTATCTGAAAACATATCTTG

  750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 1856   GAGTGCCAAAGGCAAGCATGACATCATTATGAACATAAAGTCCCAGGG
      --||   || ||:|||  ||| ::|||||||||||:||| |:||| |:: 
 3813 AGGACGTCCTAAAGCACTCATCGTATCATTATGAATATATAATCCAAAAC

  800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 1904 TATGGAATCCCAGAAAGAGGCTGGCCCAACTTAAATGAGATATGATAGCT
      ||||:|||||:|:||||| ||  :|||||:| |:||| ||||| || || 
 3863 TATGAAATCCTAAAAAGATGCATACCCAATTAAGATGTGATATTATTGCA

  850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 1954 TCTTTATGCTCTAACATTCTTGCCAATACATTATCTTCATTTTGCTCCGG
      || : |||::  |: |:||   |:||:| |||:|: |  |      ::||
 3913 TCACGATGTCGAAGAACTCGATCTAACAAATTGTTGTATTGAGTAGTTGG

  900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 2004 ATTGTAATCTCTAATGAAAAATATAGCTCCATGAGCAAAAGCTCCTGTCA
      ||::|||||||| |: | ||| |||||  |||| |||: ||| || :::|
 3963 ATCATAATCTCTTACCATAAAAATAGCAGCATGTGCAGCAGCACCAACTA

  950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 2054 TGATGAATCCTGCGATATATTGGTGGTGGGTATATAATGCAGCTTGAGTA
      | | :|||||  |:|| :|:  :||:|| ||| | |: | |: |||||||
 4013 TTAAAAATCCACCAATCCACATATGATGTGTAAAAAGAGAAAGTTGAGTA

 1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 2104 GTAAAGTCTTGTGCTATGAATGCATAAGCAGGTAAAGAGTACATGTGTTG
       :: |:||    |||| : ||| ||||| |||:| || ||||||:|| ||
 4063 CCGTAATCAGTAGCTAAATATGGATAAGGAGGCATAGCGTACATATGATG

 1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 2154 AGCTACCAAAGAAGTAATAACCCCTAAAGAAGCTAGAGCAAGGCCTAATT
      |||||| | |: ||| | |:  ||:|| : |||||:| :|||  ||||||
 4113 AGCTACAATAATAGTTAAAGAACCCAACATAGCTAAATTAAGTGCTAATT

 1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 2204 GAAAATGAAGCGAATTATTGATTGTGTCATAAAGACCCTTATGTCCACGC
      ||: |||  ::||| |  | |  :| |||||||||||:||||| || : :
 4163 GAGCATGCCATGAAGTTGTTAAAATTTCATAAAGACCTTTATGACCCTCT

 1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 2254 CCC   AATCGTCCCCCGGGGGGAATATGTGCATCTAAAAGGTCTTTCAT
      || ---||| | ||::---------|||| || |||||||  ||||| | 
 4213 CCAGTAAATGGACCTT         TATGAGCTTCTAAAATTTCTTTAAA

 1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 2301 ACTGTGCCCAATCCCGAAATTGGTTCTATACATATGACCAGCAACGAGAA
      |||:|| ||:|| ||  |:||:|| | |||||||||||| || || |:||
 4254 ACTATGACCGATACCCCAGTTAGTACGATACATATGACCTGCTACTAAAA

 1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 2351 AAATAAATGCAATAGCTAAATGGTGATGGGCAATATCAGTCAGCCATAAA
      ||| || |||||||||||||||:|||||:|| :|||||||:|:|||||||
 4304 AAAGAACTGCAATAGCTAAATGATGATGAGCTGTATCAGTTAACCATAAA

 1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 2401 CTTTGCGTTTGTGGATGGAATCCCCCGAGAAGAGTTAGAATGGCAGTTCC
      |: :  |||  ||||| :|:|||:||: |||:|||||:|| | |||----
 4354 CCGCCAGTTACTGGATTAAGTCCTCCACGAAAAGTTAAAAAGTCAG    

 1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 2451 CGCCCCTTGGGCGGTACCAAATAAATGACTACTTGAATCGGGGTTTTGAG
      ------------------||     ||||:| || || ------------
 4400                   AATATTCTGACCAATTTAAA            

 1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 2501 CATAAAGATTCCATTGACCTGTAAAAAGTGGGCCTAACCCTTGGGGA   
      --------------------|||||||: ||: :||||||||  | |---
 4420                     GTAAAAAAAGGAGTTAACCCTTTTGCAAAA

 1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 2548  TGCGGTAA  TACATCTAAGAAATTA                       
      -|: |||||--| || ||||:|:||:|-----------------------
 4450 CTAGGGTAAAGTTCAGCTAAAAGATCACGATTTAAAATAAATTCATGAGG

 1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 2572          TTCCACCGAACGTACTCC  CCTCTGGATGC        AG
      ---------|||: ::|:|:  |||||--| |||::| ||--------||
 4500 AAGAGGTATTTCTTTTGGATCAACTCCAGCATCTAAAAGCTGATTAATAG

 1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 2603 GAATAGCAACATGAACTAAATGCCCTGTCCAAGCCAAGGAACTTACGCCA
      | | || |||||| ||| :|||:|| |:|||||  |::||||:|| ||| 
 4550 GTAAAGAAACATGTACTTGATGTCCAGCCCAAGAAAGAGAACCTAAGCCT

 1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 2653 AAGAGTCCTGACAAATGATGATTCAGACGAGATTCGGCATTTTTGAACCA
      ||:|| |||| :|||||||||||:||   ||||||::|||:|| :|||||
 4600 AAAAGACCTGCTAAATGATGATTTAGCATAGATTCAACATCTTGAAACCA

 1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 2703 GGAAACGCTCGGTTTCCATTTCGGTTGTAGGTGTAACCAACCTGCTATTA
      :|  |  :|:||  :   |||  | |: ---|| ||||| ||||| |  |
 4650 AGCTAATTTTGGAGCAGCTTTGTGATAA   TGAAACCATCCTGCAAAAA

 1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 2753 AGGATATGGCAGAAAGAAATAATAGAAAAAGAGCACCAGTATAAAGATCT
      : : ||  || | ||:|| ||||  |  ||  ||| :|| |||||| | |
 4697 GCATTAATGCTGCAAAAACTAATCCACCAATTGCAGTAGAATAAAGTTGT

 1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 2803 TCATTAGTGCGTAAACCGATTGTATACCACCACTGATAAACACCAGAATA
         |:| |:  ||  ||:: ||: ::|||  ::||| ||| :||:||---
 4747 AATTCACTAGTTATTCCAGATGCTCGCCAAAGTTGAAAAAAGCCGGA   

 1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 2853 AGCGATATTCACTGGGCCAAGAGCACCCCCTCGAGTAAAAGCTTCCACGG
      ---|:|  |:  |:  ||  ||: |||||| | |::|    | |::| ::
 4794    GGTTATTTGTATTCCTTGAAAACCCCCGCCAACATCCCCATTTAAAA

 1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 2903 CCGGTTGACCAAAATGAGGATCCCAAATTGCATGAGCAATAGGTCTTACA
      ::  ||||||||    |||---|||||: :| |||||| |:||::| |:|
 4841 TTTCTTGACCAACTATAGG   CCAAACAACTTGAGCACTGGGCTTAATA

 1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 2953 TGTAAAGGGTCCTGTACCCACGACTCAAAATTTCCTTGCCAAGCTACATG
      || : |||:|| : || |||:| :||| ||||     : |:|||  ||||
 4888 TGAGTAGGATCACTTAACCATGCTTCATAATTAGAAAAACGAGCACCATG

 1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 3003 AAACAGATTTCCGGAAGTCCACAGAAAAATTATTGCTAATTGACCAAAGT
      |||  :  | ||:   : ||| | |||||| || |||||||| |||||:|
 4938 AAAGTACATACCACTTAACCAAATAAAAATGATGGCTAATTGCCCAAAAT

 2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 3053 GAGAAGCAAAAATATTCTGATAAAGACGTTCCTCAGTAATATCATCATGA
      ||| | :|||||: || :|| ||| ---|||:|| : | :||:: :|||:
 4988 GAGCACTAAAAACCTTACGAGAAAT   TTCTTCTAAATCATTGGTATGG

 2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 3103 CTCTCGAAGTCATGTGCGGTAGCAATACCAAACCAAATACGACGAGTAGT
      || ||:||:||||| ||: :||||     |  |||||| |:|  :|||||
 5035 CTGTCAAAATCATGAGCATCAGCATGTAAATTCCAAATCCAAGTGGTAGT

*********************************************************
      Number 3 Local Alignment
      Similarity Score : 255.2
      Match Percentage : 57%
      Number of Matches : 788
      Number of Mismatches : 417
      Total Length of Gaps : 159
      Begins at (3371, 884) and Ends at (4659, 2163)

    0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 3371 TGAGCCCAAACGATGGATTCAATAAGTTCTTGCCAATAACCACGTCCACT
      |||||||||:| | :| ||||||||||||||||||||| |||||:|    
  884 TGAGCCCAAGCTAAAGTTTCAATAAGTTCTTGCCAATATCCACGCCACGA

   50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 3421 GAATAGAAACATTAAACTAAAAGCCCAGACAAAATGAGCACCTAGGAAAA
       | :|||||||| || |:|: ||||||:|| |||||| ||  ||----||
  934 TATCAGAAACATAAATCCAGTAGCCCAAACTAAATGACCAAATA    AA

  100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 3471 AAAGGCCATATGCAGATAATGA                AGAACCATAAGA
      || : ||||:: ||:|:|:  |----------------||:|::|||   
  980 AACATCCATGCCCAAACAGACAGACTATTCATACCAAAAGGATTATATCC

  150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 3505 CTGAATTACCTGGGATGCCTGTGCCCATAAGAAATCGCGGAGCCACCCAT
       | |||:| :|| || |  | |: ||||||: |||| |  |:||| ||  
 1030 ATTAATCAATTGTGAAGAATTTAACCATAAATAATCTCTTAACCAGCCCA

  200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 3555 TAATAGTAATAGAACTTTGCGCAAAGTTTCCTCC     CGTGATATGAG
      | | |   :|||||  ||   :||| | | || |-----| || :||:| 
 1080 TTAAATATGTAGAAGATTCATTAAATTGTGCTGCATTTCCTTGCCATAAT

  250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 3600 TTACTACCCCTTGATCACTTACACTGCCCCAAACATCTGACTGCATTTTC
       || ||: --------------------------------------||||
 1130 GTAATATG                                      TTTC

  300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 3650 CAACTGAAATGGAATATTACTACCGAAATTGCATTGTACATCCAGAATAG
      |||:   |||::|| :| ||:  :  ||| |:|||  |||||||:|| | 
 1142 CAATGCCAATAAAAAGTAACCCATCCAATAGTATTTAACATCCAAAAAAC

  350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 3700 TCCTAAGAAGACATGATCCCAGGCCGATACTTGACATGTACCCCCTCTTC
      | ||||: |:| |  ||||||:|| || |: | ||| ||||| |||| ||
 1192 TGCTAAATAAAAAGCATCCCAAGCAGAAATATCACAAGTACCACCTCGTC

  400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 3750 CAGGTCCATCACAAGGAAAACGAAAACCAAGGTTTGCTTTATCCGGTGTC
      |||| |||||||||||||||| | ||||||: |:| :||||||:||::|:
 1242 CAGGACCATCACAAGGAAAACTATAACCAAATTCTTTTTTATCTGGCATT

  450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 3800 AAACGGGAACTGCGAGCAAATAGAACACCTTTCAAGAGTATCAGTGCCGT
      || : :|| |: || |||  ||:|:|||||||||  |: ||:|:||: ||
 1292 AATTTAGATCCTCGTGCATCTAAAGCACCTTTCACTAAAATTAATGTAGT

  500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 3850 CACATGAATCGTAAATGCATGAATGTGATGTACCAAGAAATCCGCGGTTC
       ::||| |   : || |||  |::|||||||||:||:||:||: |:|  |
 1342 AGTATGTAAACCTAAAGCAATAGCGTGATGTACTAAAAAGTCTCCAGGAC

  550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 3900 CTAATG    GAATAG                      GCAACAAAGCCA
      | | ||----||| ||----------------------||| | || | |
 1392 CAATTGTTAAGAAAAGTGAATTACTATTATTATTTATAGCATCTAACCAA

  600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 3924 CCTTGCCACCCACTGC         CACTAAATCACCACCCCCCCAAGTT
      ||  |: |||   |||---------||:||||| ----------------
 1442 CCAGGTAACCATATGCTTTGACCAGCATTAAATG                

  650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 3965 AAACTGG  TACTTGCTGTTGCACCAGGAGCCGTTGCACCAGGT   GCT
      ---||||--||:|||:|| ||    |:| :|  : : |||| :|---|||
 1476    CTGGATTATTTGTTGATGATAAAAGTACATCAAAACCATATAAAGCT

  700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 4010 AAAGCATGGGTGTTTTGTATCCATTGAGCAAAAACGGGTTGTAATTGTAT
        | ||||:|::  ||||||||||||||||||||::||||  | | ----
 1523 TTACCATGAGCAGATTGTATCCATTGAGCAAAAATAGGTTCAATTA    

  750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 4060 AGCGGTATCTGAAAACATATCTTGAGGACGCCCTAAAGCGCTCATGGTAT
      -----------||| :   |:|| ||||   || |||||:  |||:::||
 1569            AAATTTGTTTTTCAGGAGTACCAAAAGCAAGCATAACAT

  800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 4110 CATTATGAATATACAAACCAAAACTGTGAAAGCCTAGAAATATACATGCC
      |||||||||::|| |:||| ||| |:||||| |||||||||| ||  |||
 1608 CATTATGAACGTAAAGACCTAAAGTATGAAATCCTAGAAATAAACTAGCC

  850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 4160 CAGTTGAGATGGGATATGATTGCATCACGATGTCTAAGGACACGATCTAA
      ||::| |:||||||||| || || || : ||||:: |: |: | | ||||
 1658 CAACTTAAATGGGATATTATAGCTTCTTTATGTTCTAACATTCTAGCTAA

  900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 4210 TAGATCGT        TGTACCGAGTAGTTGGATCATAATCTCTTACCAT
      || ||::|--------||| |||--------|||:||||||||| |: | 
 1708 TACATTATCTTTATTTTGTTCCG        GATTATAATCTCTAATAAA

  950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 4252 AAAAATGGCTGCATGCGCGGCAGCACCAACTATGAGAAATCCACCAATCC
      :|||||:||| |||| ||:: |||||| :::||:| ||| ||| |||| :
 1750 GAAAATAGCTCCATGAGCAAAAGCACCTGTCATAATAAAACCAGCAATAT

 1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 4302 ACATGTGATGTGTGAACAATGACAGTTGTGTACCATAGTCAGTAGCTAGA
      |:  :||||| ||: |:||||  : |||:||  :| |:||    || |||
 1800 ATTGATGATGAGTATATAATGCAGCTTGCGTTGTAAAATCTTGTGCAAGA

 1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 4352 TACGGATAAGGGGGCATGGAATACATATGGTGAGCTACAACAATGGTTAA
       ||| |||:||:||:| :||||||||||| |||||||| | :: ||| | 
 1850 AACGCATAGGGAGGTAAAGAATACATATGTTGAGCTACTAAGGAGGTAAT

 1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 4402 AGAGCCTAACATAGCTAAGTTAAGAGATAATTGAGCATGCCATGACGTTG
      |:  ||||||:  |||||: :||||  |||||||: |||  : ||  |  
 1900 AACTCCTAACGATGCTAAAGCAAGACCTAATTGAAAATGAAGAGAATTGT

 1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 4452 TTAGGATCTCATATAGGCCTTTATGGCCCTGACCTGTAAATGGACCTT  
      | | ::| ||||| ||:|||||||| ||::|||||: | :|   ||| --
 1950 TAATAGTATCATAAAGACCTTTATGTCCTCGACCTAAACGTCCTCCTGGA

 1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 4500     TATGAGCTTCTAAAATATCTTTTAGTCCATGACCAATACCCCAGTT
      ----||||:|:||| |:||| ||||| |  |:||||||||| ||  |:||
 2000 GGAGTATGGGTTTCAAGAATTTCTTTGATACTATGACCAATTCCAAAATT

 1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 4546 GGTCCTATACATGTGACCCGCTATCAGGAAAAGAATTGCAATAGCTAAAT
      :||:||||||||:||||| ||||| | :|||| ||:||||||||||||||
 2050 AGTTCTATACATATGACCAGCTATAATAAAAACAACTGCAATAGCTAAAT

 1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 4596 GGTGATGGGCAATATCAGTCAGCCACAGACCCCCAGTTACTGGATCTAAT
      |:||:||:||||||||||| |||||:|:||:::  |||  |||||  |||
 2100 GATGGTGAGCAATATCAGTAAGCCATAAACTTTGTGTTTGTGGATGAAAT

 1350     .    :
 4646 CCTCCACGAAAAGT
      || |||  ||||||
 2150 CCACCAATAAAAGT

*********************************************************
      Number 4 Local Alignment
      Similarity Score : 37.4
      Match Percentage : 64%
      Number of Matches : 89
      Number of Mismatches : 45
      Total Length of Gaps : 3
      Begins at (4829, 2339) and Ends at (4962, 2475)

    0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 4829 ACATGTACTTGATGCCCCGCCCAAGAGAGAGACCCAAGTCCTAGTAGCCC
      ||||| ||| :||| ||:|:|||||  |: || |: |  || |: ||:||
 2339 ACATGAACTAAATGACCTGTCCAAGCTAATGAGCTTACACCAAAAAGTCC

   50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 4879 TGCCAAATGGTGATTCAGCATAGATTCTACATCTTGAAACCAAGCCAATT
      || :|||||:|||||:|:   |||||| :|||:|| ||||||:| :| ||
 2389 TGATAAATGATGATTTAAACGAGATTCAGCATTTTTAAACCAGGATACTT

  100     .    :    .    :    .    :    .
 4929 TTGGCGCCGCTTTATGAT   AATGAAACCAACCAGC
      | ||: :|  |||| | |---|||| |||||||| ||
 2439 TAGGTTTCCATTTAGGTTGTAAATGTAACCAACCTGC

*********************************************************
      Number 5 Local Alignment
      Similarity Score : 28
      Match Percentage : 59%
      Number of Matches : 88
      Number of Mismatches : 60
      Total Length of Gaps : 0
      Begins at (5131, 2653) and Ends at (5278, 2800)

    0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 5131 CCAAACCACCTGGGCACTAGGCCCAATGTGAGTTGGATCACTTAGCCACG
      |||||:::| ||:||| | ||:|::|::|| :  ||:|| : |  |||:|
 2653 CCAAATTGCATGAGCAATTGGTCTGACATGTAAAGGGTCTTGTCCCCATG

   50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 5181 CTTCATAATTAGAAAAACGAGCACCGTGGAAATACATGCCGCTCAGCCAA
      ||||| |||||    : |:|||| ||||:||  |  |:||:   : ||| 
 2703 CTTCAAAATTACCTTGCCAAGCAACGTGAAATAAATTACCAGAAGTCCAT

  100     .    :    .    :    .    :    .    :    .
 5231 AGAAAGATGATGGAGAGTTGACCGAAATGTGCACTAAATACTTTTCGA
      |:|||:||||| |  |:||||||:|||||||   :||| |::|||:||
 2753 AAAAAAATGATTGCTAATTGACCAAAATGTGACGCAAAAATCTTTTGA

*********************************************************
      Number 6 Local Alignment
      Similarity Score : 18
      Match Percentage : 72%
      Number of Matches : 29
      Number of Mismatches : 11
      Total Length of Gaps : 0
      Begins at (5929, 5950) and Ends at (5968, 5989)

    0     .    :    .    :    .    :    .    :
 5929 TAGTTTTAATAATAAGAATTTTGTTTAATTTAATATAATA
      |||  | ||||| ||:||  ||:|||||  |||||:||||
 5950 TAGAGTAAATAAAAAAAAGGTTATTTAAAATAATACAATA

*********************************************************
      Number 7 Local Alignment
      Similarity Score : 17.6
      Match Percentage : 60%
      Number of Matches : 42
      Number of Mismatches : 16
      Total Length of Gaps : 12
      Begins at (2981, 918) and Ends at (3050, 975)

    0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
 2981 AATTTCCTTGCCAAGCTACATGAAACAGATTTCCGGAAGTCCACAGAAAA
      ||| ||| :|||| | ||:  |||||| |  |||:| ||:||| |-----
  918 AATATCCACGCCACGATATCAGAAACATAAATCCAGTAGCCCAAA     

   50     .    :    .    :
 3031 ATTATTGCTAATTGACCAAA
      -------|||| ||||||||
  963        CTAAATGACCAAA

*********************************************************
      Number 8 Local Alignment
      Similarity Score : 17
      Match Percentage : 71%
      Number of Matches : 28
      Number of Mismatches : 11
      Total Length of Gaps : 0
      Begins at (4481, 3583) and Ends at (4519, 3621)

    0     .    :    .    :    .    :    .
 4481 TGACCTGTAAATGGACCTTTATGAGCTTCTAAAATATCT
      ||| :|||||||| |:   |||||  | |||||| ||||
 3583 TGAATTGTAAATGCATGAATATGATGTACTAAAAAATCT
exit 0